Wir freuen uns, die Integration von BIDS (Brain Imaging Data Structure) mit LinkAhead, einem fortschrittlichen Open-Source-System zur Verwaltung von Forschungsdaten, bekannt zu geben. Durch diese Integration werden die leistungsstarken Datenverwaltungsfunktionen von LinkAhead auf BIDS-kompatible Datenstrukturen übertragen. LinkAhead ist ein Open-Source-Datenverwaltungssystem, das entwickelt wurde, um die Herausforderungen zu bewältigen, denen Forscher:innen bei der effizienten Speicherung, Organisation und Analyse großer und komplexer Datensätze gegenüberstehen. Es bietet eine flexible und skalierbare Infrastruktur, die eine nahtlose Integration verschiedener Datentypen ermöglicht und so die Zusammenarbeit und datengesteuerte Entdeckungen erleichtert.
Mit unserem neuen Modul integriert sich der LinkAhead-Crawler nahtlos in BIDS-Ordnerstrukturen und ermöglicht so ein effizientes Datenmanagement und eine verbesserte Zusammenarbeit, insbesondere in Projekten, in denen BIDS mit anderen Datenstrukturen verwendet wird. Hier sind die wichtigsten Highlights der Integration:
- BIDS-kompatibles Daten-Parsing: Unser Modul kann nun Ordnerstrukturen lesen, die der BIDS-Spezifikation entsprechen. Es analysiert die Datei dataset_description.json sowie Datei- und Ordnernamen, extrahiert Schlüssel-Wert-Paare und übersetzt sie in LinkAhead-Entitäten. Dadurch wird sichergestellt, dass Ihre BIDS-Metadaten nahtlos in den LinkAhead integriert werden.
- Verbesserte Datenorganisation: Die BIDS-Daten können intuitiv in LinkAhead mit anderen Daten integriert werden. Dies ermöglicht explizite Verweise zwischen verschiedenen Datenentitäten (BIDS und Nicht-BIDS) und erleichtert die Speicherung wichtiger Beziehungen und Informationen.
- Verbesserte Suchmöglichkeiten: Eine große Stärke von LinkAhead ist die Suchfunktion. Die Integration erlaubt es nicht nur, sie auf die BIDS-Daten anzuwenden, sondern auch in Bezug auf andere verwaltete Daten. So können Sie beispielsweise alle T1-gewichteten Bilder von Fächern abrufen, für die auch einige Nicht-BIDS-Daten in LinkAhead vorhanden sind. Dadurch wird sichergestellt, dass Ihre BIDS-Daten leicht durchsuchbar und zugänglich sind.
Wir freuen uns über das Potenzial dieser Integration, die Benutzerfreundlichkeit und Zugänglichkeit des beispielhaften Forschungsdatenmanagements, das der BIDS-Standard bietet, weiter zu verbessern. Forscher können nun die Vorteile beider Rahmenwerke nutzen, um eine effiziente Datenverwaltung zu gewährleisten und die Reproduzierbarkeit zu fördern.
Wir würden uns über Ihr Feedback freuen und werden am 27.6. um 15:00 Uhr MESZ eine Online-Veranstaltung zur BIDS-Integration durchführen. In dieser Online-Veranstaltung werden wir vorstellen, wie Sie BIDS in LinkAhead integrieren können. Wir werden veranschaulichen, wie die Arbeit mit BIDS und LinkAhead aussehen kann und freuen uns auf eine Diskussion mit der BIDS-Community.
- Matrix-Channel: https://matrix.to/#/#linkahead:matrix.org
- LinkAhead: https://www.indiscale.com/linkahead/
- Source Code: https://gitlab.indiscale.com/caosd
https://app.bbbserver.de/de/join/f7b3aa40-9211-432e-8436-924b1db49542